Maria что это за программа

MARIA (MHC Analyzer with Recurrent Integrated Architecture) is an integrated tool to predict how likely a peptide to be presented by HLA-II complexes on cell surface. MARIA deep neural network learned from over 60,000 naturally presented HLA-II peptide ligands considering their gene expression levels, binding affinities, cleavage signatures, and peptide sequences. Our work showed MARIA better identify presented HLA-II antigens and CD4 T-cell epitopes than conventional tools trained on in vitro binding affinities. MARIA for HLA-I is under active development.

Implementation Details

MARIA was developed in python to be run via our website or command line. Users supply HLA-II alleles, gene names, and peptide sequences for each query (see Input File below for details). For each peptide, MARIA outputs a raw score (0-1) and normalized percentiles against an independent human peptides sequences (0-100%). High numbers indicate higher probabilities of presentation. Using 95% as cut-off to call positive presenters roughly ensures a specificity of 95%. Our website allows users to run 5,000 lines of peptides per query. Users should download the python script and run any jobs with >5000 lines of peptides. See the README file in the python script package for instructions. Commercial users need to obtain a license from Stanford University before using MARIA. See Non-Commercial Terms of Use.

Input File

Users should modify the input file template from the Download section. The input file is a plain tap-delimited text file with a header and 5 required columns. Column 1 and 2 are HLA-DR or DQ alleles of the cells (see Supported Alleles for details). Column 3 is the gene symbol (e.g. CTSK) of genes encoding the peptide of interest. Column 4 is peptide sequences in single letter format (all capitalized, no space). Column 5 is optional gene expression values if users want to provide specific gene expression values for this antigen gene (in TPM). Otherwise gene expression values will be estimated from external RNA-Seq references (e.g. TCGA) and genes with unknown gene expression will be assigned with a TPM of 5.

Funding

This work was supported by the National Institutes of Health (NIH) U01 CA194389 (M.M.D., R.L., J.E.E., A.A.A.), NIH K08 CA207882 (M.S.K.), NIH GM 102365 (R.B.A.), NIH S10 RR02933801, NIH/Stanford MSTP training grant (B.C.), NSF GSF (E.F.), American Society of Hematology Scholar Award (A.A.A.), V-Foundation (A.A.A.), Damon Runyon-Rachleff Innovation Award (J.E.E.), W.M. Keck Foundation Medical Research Grant (J.E.E.), Conquer Cancer Foundation Young Investigator Award (M.S.K.), Leukemia & Lymphoma Society (M.S.K.), Knut and Alice Wallenberg Foundation Postdoctoral Fellowship (N.O.), Parker Institute for Cancer Immunotherapy Bedside to Benchtop Grant (A.A.A.), PD Soros New American Fellowship (B.C.), Stanford Bio-X Fellowship (B.C.). This work used the XStream computational resource, supported by the National Science Foundation Major Research Instrumentation program (ACI-1429830). This work used the shared FACS facility, supported by NIH S10 Shared Instrument Grant (S10RR027431-01).

To start using MARIA right away, press here or click here to start with a tutorial.

Please send questions, issues, and/or licensing requests to: [email protected]

Maria. Простейший менеджер загрузки сайтов

На страницах нашего сайта мы уже не раз рассказывали о приложениях для скачивания сайтов целиком, а не по одной странице, как это умеют делать веб-браузеры. В частности, героями наших обзоров в свое время становились WebDevil и SiteSucker, отличающие друг от друга как стоимостью, так и функционалом. Между тем, это далеко не единственые решения, позволяющие загрузить целиком тот или иной сайт на жесткий диск пользователя. Сегодня мы расскажем о совсем маленьком приложении с красивым названием Maria, которое не хуже (а в некоторых случаях и лучше) справляется с поставленной задачей, нежели вышеназванные программы.

Если бы до конца честным, то Maria является не совсем самостоятельным приложением — это скорее надстройка, если хотите графическая оболочка популярного кроссплатформенного консольного приложения для загрузки файлов по сети под названием Wget. Впрочем, точно такой же оболочкой является и упоминаемый выше WebDevil, так что это вряд ли можно назвать недостатком.

Maria обладает сверхминималистичным Cocoa-интерфейсом с простым, но симпатичным дизайном рабочего окна, представляющего собой одну большую панель инструментов. Большую не в плане размера, а в том смысле, что она занимает всю площадь окна программы.

Разработчиком заявлена локализация интерфейса программы и меню настроек на четырех языках: английском, итальянском, польском и португальском. Русский среди них отсутствует, но это как раз один из тех случаев, когда наличие русской локализации совсем некритично — все организовано настолько просто, что работа с программой не вызовет затруднений у пользователя, незнакомого ни с одним из означенных языков, разве что придется посмотреть пару слов в словаре, когда придется познакомиться с меню настроек. Язык интерфейса выставляется в соответствии с языком в системе, во всех прочих случаях используется англоязычный вариант.

Работать с программой не просто, а очень просто: в соответствуюшем поле указываем адрес нужного сайта (Maria умеет работать с HTTP-, HTTPS- и FTP-протоколами) и нажимаем ENTER (RETURN) на клавиатуре или кликаем мышкой по кнопке начала операции.

В процессе работы программа не выводит на экран каких-либо данных о загружаемых в данный момент файлах. О том, что Maria продолжает работать пользователь может судить только по анимированному индикатору загрузки. Кнопки под индикатором позволяют приостановить процесс загрузки сайта, либо вовсе его остановить.

Несмотря на свою простоту, Maria одинаково хорошо умеет работать как с общедоступными секциями сайтов, так и с требующими авторизации. Для этого достаточно в соответствующем окне указать данные аккаунта пользователя на выбранном сайте.

При загрузке сайта программа может сохранить все файлы в одну общую папку, указанную в настройках или же наоборот, разложить их по отдельным папкам, так, как они лежат на сайте. Там же в настройках можно указать глубину следования по ссылкам и дать указание приложению загружать файлы только определенного типа.

Удивительно, но Maria оказалась единственным приложением из прочих рассмотренных нами аналогов, которое действительно загружает только те типы файлов, которые были указаны в настройках. Тот же бесплатный SiteSucker, несмотря на явное указание скачивать, например, только графические файлы, продолжает загружать все, что найдет по указанному адресу, в то время как Maria файлы других форматов акуратно пропускала. Другой, достаточно важной особенностью программы является возможность ограничить ширину канала загрузки, дабы не забирать весь канал под себя, оставляя возможность для других приложений работать с сетью во время загрузки сайта.

Как и многие другие подобные приложения, Maria умеет представляться веб-браузером (некоторые сайты запрещают загрузку своего содержимого подобными программами), имитировать действия пользователя, выжидая заданную паузу перед загрузкой очередного файла, а также выполнять ряд других функций, в число которых входит возможность работы через прокси.

Среди прочих возможностей программы можно отметить возможность автоматического импорта веб-адресов из списка в текстовом файле, а также безупречную работу в Mac OS X Lion. При сравнениями с другими аналогичными приложениями в актив Maria можно занести и то, что она является 64-битным приложением.

Maria являет собой пример простого, но, в то же время, достаточно умелого и полезного приложения, эффективно выполняющего свою работу. Действительно, в программе нет различных плюшек типа возможности просмотра загруженных файлов, работы с закладками цеб-браузера, создания букмарклета и пр., но с основной своей обязанностью — загрузкой сайта или файлов определенного типа, она справляется на «отлично». Приложению несколько не хватает информативности и возможности для пользователя самостоятельно указывать форматы файлов для загрузки, а не выбирать одну из предустановок, но мы надеемся, что все это появится в следующих версиях программы.

Удаление Maria: Удалите Maria Навсегда

Что такое Maria

Скачать утилиту для удаления Maria

Удалить Maria вручную

Получить проффесиональную тех поддержку

Читать комментарии

Описание угрозы

Имя исполняемого файла:

Maria

(random file).exe

Ransomware

Win32 (Windows XP, Windows Vista, Windows Seven, Windows 8)

Метод заражения Maria

Maria копирует свои файл(ы) на ваш жёсткий диск. Типичное имя файла (random file).exe. Потом он создаёт ключ автозагрузки в реестре с именем Maria и значением (random file).exe. Вы также можете найти его в списке процессов с именем (random file).exe или Maria.

Если у вас есть дополнительные вопросы касательно Maria, пожалуйста, заполните эту форму и мы вскоре свяжемся с вами.

Скачать утилиту для удаления

Скачайте эту программу и удалите Maria and (random file).exe (закачка начнется автоматически):

* SpyHunter был разработан американской компанией EnigmaSoftware и способен удалить удалить Maria в автоматическом режиме. Программа тестировалась на Windows XP, Windows Vista, Windows 7 и Windows 8.

Функции

Удаляет все файлы, созданные Maria.

Удаляет все записи реестра, созданные Maria.

Программа способна защищать файлы и настройки от вредоносного кода.

Программа может исправить проблемы с браузером и защищает настройки браузера.

Удаление гарантированно — если не справился SpyHunter предоставляется бесплатная поддержка.

Антивирусная поддержка в режиме 24/7 входит в комплект поставки.

Скачайте утилиту для удаления Maria от российской компании Security Stronghold

Если вы не уверены какие файлы удалять, используйте нашу программу Утилиту для удаления Maria.. Утилита для удаления Maria найдет и полностью удалит Maria и все проблемы связанные с вирусом Maria. Быстрая, легкая в использовании утилита для удаления Maria защитит ваш компьютер от угрозы Maria которая вредит вашему компьютеру и нарушает вашу частную жизнь. Утилита для удаления Maria сканирует ваши жесткие диски и реестр и удаляет любое проявление Maria. Обычное антивирусное ПО бессильно против вредоносных таких программ, как Maria. Скачать эту упрощенное средство удаления специально разработанное для решения проблем с Maria и (random file).exe (закачка начнется автоматически):

Функции

Удаляет все файлы, созданные Maria.

Удаляет все записи реестра, созданные Maria.

Программа может исправить проблемы с браузером.

Иммунизирует систему.

Удаление гарантированно — если Утилита не справилась предоставляется бесплатная поддержка.

Антивирусная поддержка в режиме 24/7 через систему GoToAssist входит в комплект поставки.

Наша служба поддержки готова решить вашу проблему с Maria и удалить Maria прямо сейчас!

Оставьте подробное описание вашей проблемы с Maria в разделе Техническая поддержка. Наша служба поддержки свяжется с вами и предоставит вам пошаговое решение проблемы с Maria. Пожалуйста, опишите вашу проблему как можно точнее. Это поможет нам предоставит вам наиболее эффективный метод удаления Maria.

Как удалить Maria вручную

Эта проблема может быть решена вручную, путём удаления ключей реестра и файлов связанных с Maria, удалением его из списка автозагрузки и де-регистрацией всех связанных DLL файлов. Кроме того, отсутствующие DLL файлы должны быть восстановлены из дистрибутива ОС если они были повреждены Maria.

Чтобы избавиться от Maria, вам необходимо:

1. Завершить следующие процессы и удалить соответствующие файлы:

Предупреждение: вам необходимо удалить только файлы, контольные суммы которых, находятся в списке вредоносных. В вашей системе могут быть нужные файлы с такими же именами. Мы рекомендуем использовать Утилиту для удаления Maria для безопасного решения проблемы.

2. Удалите следующие папки:

3. Удалите следующие ключи и\или значения ключей реестра:

Предупреждение: Если указаны значения ключей реестра, вы должны удалить только указанные значения и оставить сами ключи нетронутыми. Мы рекомендуем использовать Утилиту для удаления Maria для безопасного решения проблемы.

Как предотвратить заражение рекламным ПО? Мы рекомендуем использовать Adguard:

4. Сбросить настройки браузеров

Maria иногда может влиять на настройки вашего браузера, например подменять поиск и домашнюю страницу. Мы рекомендуем вам использовать бесплатную функцию «Сбросить настройки браузеров» в «Инструментах» в программе Spyhunter Remediation Tool для сброса настроек всех браузеров разом. Учтите, что перед этим вам надо удалить все файлы, папки и ключи реестра принадлежащие Maria. Для сброса настроек браузеров вручную используйте данную инструкцию:

Для Internet Explorer

Если вы используете Windows XP, кликните Пуск, и Открыть. Введите следующее в поле Открыть без кавычек и нажмите Enter: «inetcpl.cpl».
Если вы используете Windows 7 или Windows Vista, кликните Пуск. Введите следующее в поле Искать без кавычек и нажмите Enter: «inetcpl.cpl».
Выберите вкладку Дополнительно
Под Сброс параметров браузера Internet Explorer, кликните Сброс. И нажмите Сброс ещё раз в открывшемся окне.
Выберите галочку Удалить личные настройки для удаления истории, восстановления поиска и домашней страницы.
После того как Internet Explorer завершит сброс, кликните Закрыть в диалоговом окне.

Предупреждение: В случае если это не сработает используйте бесплатную опцию Сбросить настройки браузеров в Инструменты в программе Spyhunter Remediation Tool.

Для Google Chrome

Найдите папку установки Google Chrome по адресу: C:\Users\»имя пользователя»\AppData\Local\Google\Chrome\Application\User Data.
В папке User Data, найдите файл Default и переименуйте его в DefaultBackup.
Запустите Google Chrome и будет создан новый файл Default.
Настройки Google Chrome сброшены

Для Mozilla Firefox

Откройте Firefox
В меню выберите Помощь >Информация для решения проблем.
Кликните кнопку Сбросить Firefox.
После того, как Firefox завершит, он покажет окно и создаст папку на рабочем столе. Нажмите Завершить.

Предупреждение: Так вы потеряте выши пароли! Рекомендуем использовать бесплатную опцию Сбросить настройки браузеров в Инструменты в программе Spyhunter Remediation Tool.

При подготовке материала использовались источники:
https://maria.stanford.edu/about.php

Maria. Простейший менеджер загрузки сайтов

https://www.securitystronghold.com/ru/gates/maria.html